Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms