Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 ALG14YBR070C 714 nt2.3□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 GCD10YNL062C 1437 nt2.3□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 SWA2YDR320C 2007 nt2.3□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 NEW1YPL226W 3591 nt2.3□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YOL098CYOL098C 3114 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 PBS2YJL128C 2007 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YLR108CYLR108C 1458 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YRB1YDR002W 606 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YDR290WYDR290W 330 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YGR050CYGR050C 357 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 BET5YML077W 480 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 GRX1YCL035C 333 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 SCD5YOR329C 2619 nt2.29□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 SCY1YGL083W 2415 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 DNF1YER166W 4716 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 FMN1YDR236C 657 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 AIM36YMR157C 768 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 YNL276CYNL276C 396 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 HRT1YOL133W 366 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 TFB1YDR311W 1929 nt2.28□□□□□ -2.04
YMR226CQ05016 SPB1YCL054W 2526 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YDR193WYDR193W 399 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 ADH4YGL256W 1149 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 PEX18YHR160C 852 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YOR283WYOR283W 693 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 BTS1YPL069C 1008 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 ISU1YPL135W 498 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 POS5YPL188W 1245 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 CTP1YBR291C 900 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YPK1YKL126W 2043 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SSD1YDR293C 3753 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 TRS130YMR218C 3309 nt2.27□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 MRP10YDL045W-A 288 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 FIP1YJR093C 984 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 AIM32YML050W 936 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 PEX17YNL214W 600 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 RFC5YBR087W 1065 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YDR061WYDR061W 1620 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 BIT61YJL058C 1632 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 MUB1YMR100W 1863 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 IRC8YJL051W 2469 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YEF3YLR249W 3135 nt2.26□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 PHO91YNR013C 2685 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YKL075CYKL075C 1353 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SDC25YLL016W 3147 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YFH1YDL120W 525 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YDL186WYDL186W 834 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 TIM9YEL020W-A 264 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 BOS1YLR078C 735 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 POP8YBL018C 402 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YPL276WYPL276W 438 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 TPS2YDR074W 2691 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 MCD1YDL003W 1701 nt2.25□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YNL018CYNL018C 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 OSW7YFR039C 1533 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SAE2YGL175C 1038 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 COG2YGR120C 789 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 DSE2YHR143W 978 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YKL162CYKL162C 1209 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 RPL36AYMR194W 303 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 TSR4YOL022C 1227 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 ATG5YPL149W 885 nt2.24□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 TRM2YKR056W 1920 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 EMI1YDR512C 564 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YGR111WYGR111W 1203 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 RPL6BYLR448W 531 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 GCY1YOR120W 939 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SGS1YMR190C 4344 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 ERT1YBR239C 1590 nt2.23□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SAP185YJL098W 3177 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 NOP56YLR197W 1515 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 AI3Q0060 1248 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 MFA1YDR461W 111 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 DIG2YDR480W 972 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 VEL1YGL258W 621 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 AYR1YIL124W 894 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YLL044WYLL044W 447 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 COA4YLR218C 453 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SPC24YMR117C 642 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 ECM13YBL043W 774 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YMR320WYMR320W 306 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 YPR142CYPR142C 564 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 SEC16YPL085W 6588 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 ROY1YMR258C 1662 nt2.22□□□□□ -2.05
YMR226CQ05016 MSB1YOR188W 3414 nt2.21□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms