Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBE1Q04446 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBE1Q04446 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms