Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTN2Q02246 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms