Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SATB1Q01826 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms