Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BEX3Q00994 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms