Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFAMQ00059 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAMQ00059 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms