Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMF1P82094 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMF1P82094 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMF1P82094 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMF1P82094 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMF1P82094 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMF1P82094 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMF1P82094 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMF1P82094 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms