Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOMO3P69849 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOMO3P69849 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms