Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-21P61565 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-21P61565 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-21P61565 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms