Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL23P55773 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL23P55773 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL23P55773 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL23P55773 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL23P55773 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL23P55773 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms