Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIRAP54198 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRAP54198 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRAP54198 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRAP54198 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRAP54198 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIRAP54198 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIRAP54198 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIRAP54198 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms