Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMTNP53814 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMTNP53814 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMTNP53814 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMTNP53814 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMTNP53814 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms