Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB28P51157 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB28P51157 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB28P51157 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB28P51157 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB28P51157 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB28P51157 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB28P51157 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB28P51157 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms