Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTCFP49711 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTCFP49711 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTCFP49711 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTCFP49711 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTCFP49711 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTCFP49711 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTCFP49711 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTCFP49711 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTCFP49711 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTCFP49711 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTCFP49711 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTCFP49711 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTCFP49711 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms