Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTPAP49638 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTPAP49638 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTPAP49638 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TTPAP49638 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TTPAP49638 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms