Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD4P46934 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms