Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNA1P35221 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms