Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP2P32456 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBP2P32456 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBP2P32456 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBP2P32456 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBP2P32456 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms