Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms