Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B4P23634 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP2B4P23634 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B4P23634 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms