Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACO1P21399 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACO1P21399 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACO1P21399 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACO1P21399 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACO1P21399 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACO1P21399 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACO1P21399 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACO1P21399 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACO1P21399 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACO1P21399 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACO1P21399 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms