Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA1P15085 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA1P15085 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA1P15085 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA1P15085 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA1P15085 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms