Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRAFP15056 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRAFP15056 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRAFP15056 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRAFP15056 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BRAFP15056 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRAFP15056 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRAFP15056 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRAFP15056 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRAFP15056 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRAFP15056 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRAFP15056 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms