Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL5P13501 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL5P13501 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL5P13501 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL5P13501 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL5P13501 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms