Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM200BP0CF97 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms