Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFMP07197 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFMP07197 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFMP07197 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFMP07197 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFMP07197 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFMP07197 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms