Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms