Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGAP02671 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FGAP02671 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGAP02671 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGAP02671 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGAP02671 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGAP02671 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGAP02671 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGAP02671 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGAP02671 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGAP02671 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FGAP02671 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FGAP02671 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FGAP02671 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms