Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGKV1-17P01599 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGKV1-17P01599 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms