Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR1AO95602 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms