Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms