Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG12O94817 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG12O94817 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG12O94817 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG12O94817 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG12O94817 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms