Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms