Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FLOT1O75955 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLOT1O75955 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms