Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN3O75935 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms