Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPM3O75607 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPM3O75607 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPM3O75607 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPM3O75607 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPM3O75607 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPM3O75607 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPM3O75607 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPM3O75607 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPM3O75607 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms