Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPFIA2O75334 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA2O75334 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms