Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP9BO43861 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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