Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDIL3O43854 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDIL3O43854 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDIL3O43854 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.2 ms