Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MSI1O43347 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MSI1O43347 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MSI1O43347 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MSI1O43347 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MSI1O43347 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MSI1O43347 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSI1O43347 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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MSI1O43347 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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MSI1O43347 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSI1O43347 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MSI1O43347 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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