Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP290O15078 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP290O15078 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP290O15078 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP290O15078 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP290O15078 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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