Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAMP3O14828 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP3O14828 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms