Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PODXLO00592 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXLO00592 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PODXLO00592 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PODXLO00592 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXLO00592 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXLO00592 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms