Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms