Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC01387J3KSC0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01387J3KSC0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms