Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
E9PCH4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
E9PCH4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E9PCH4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E9PCH4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
E9PCH4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
E9PCH4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
E9PCH4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
E9PCH4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
E9PCH4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
E9PCH4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
E9PCH4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
E9PCH4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
E9PCH4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
E9PCH4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms