Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMGB1P1B2RPK0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms