Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC169A6NNP5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms