Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms